MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 plasmid pGYMC6101

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013412	TAC	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013412	A	6	6	29	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013412	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013412	A	6	6	116	121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013412	TCT	2	6	157	162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013412	A	6	6	178	183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013412	CTA	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013412	AT	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013412	A	6	6	1431	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013412	CAT	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013412	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013412	CTT	2	6	2435	2440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013412	TGG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013412	TTTG	2	8	2620	2627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013412	CTA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013412	T	6	6	2675	2680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013412	TTG	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013412	GGT	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013412	CTG	2	6	2766	2771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013412	TTC	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013412	CCT	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013412	TGT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013412	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013412	GCT	2	6	3041	3046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013412	TAC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013412	AAT	2	6	3106	3111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013412	CCT	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013412	TGGT	2	8	4354	4361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013412	T	6	6	4403	4408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013412	T	7	7	4464	4470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013412	AAC	2	6	4478	4483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013412	ATTT	2	8	4495	4502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013412	TGG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013412	AAT	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013412	TAA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013412	CAG	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013412	ATT	2	6	4643	4648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013412	GTT	2	6	4684	4689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013412	GTT	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013412	TGT	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013412	T	6	6	4931	4936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013412	TCA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013412	TCG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013412	TAGA	2	8	5002	5009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013412	ATA	2	6	5018	5023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013412	AGG	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013412	T	7	7	7152	7158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013412	T	6	6	7175	7180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013412	TC	3	6	9058	9063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013412	TTTG	2	8	9094	9101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013412	TTG	2	6	9127	9132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013412	GTAT	2	8	9157	9164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013412	ATT	2	6	9189	9194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013412	AATA	2	8	9231	9238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013412	AGA	2	6	9250	9255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013412	GAA	2	6	9267	9272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013412	GGTG	2	8	9274	9281	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013412	T	7	7	10386	10392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013412	TCG	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013412	T	6	6	13781	13786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013412	A	6	6	13822	13827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013412	TCC	2	6	13829	13834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013412	C	6	6	13833	13838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_013412	CAT	2	6	13848	13853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013412	T	6	6	13897	13902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013412	A	6	6	13910	13915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013412	TTG	2	6	13919	13924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013412	TAC	2	6	14395	14400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013412	ATC	2	6	14463	14468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013412	GCT	2	6	14514	14519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013412	GAA	2	6	14521	14526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013412	AATA	2	8	14538	14545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013412	TGA	2	6	14548	14553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013412	TAA	3	9	14554	14562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013412	TTC	2	6	14615	14620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013412	GCC	2	6	14683	14688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013412	CCGG	2	8	14706	14713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013412	GAA	2	6	14744	14749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013412	CTGC	2	8	14775	14782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013412	CCG	2	6	14820	14825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013412	ATT	2	6	14844	14849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013412	T	7	7	14848	14854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013412	TGA	2	6	15126	15131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013412	AAAT	2	8	15138	15145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013412	GGA	2	6	15146	15151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013412	GT	3	6	15258	15263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013412	CG	3	6	15318	15323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013412	GTT	2	6	15332	15337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013412	AGGG	2	8	15346	15353	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013412	TCG	2	6	16697	16702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013412	TAT	2	6	16709	16714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013412	TGCT	2	8	16726	16733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013412	GTT	2	6	16767	16772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013412	CAT	2	6	16779	16784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013412	TGG	2	6	16790	16795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013412	G	7	7	16794	16800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013412	GATT	2	8	16895	16902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013412	TTA	2	6	16942	16947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013412	TGGT	2	8	16978	16985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013412	GAT	2	6	16986	16991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013412	ATT	2	6	16995	17000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013412	CAA	2	6	17029	17034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013412	CTC	2	6	17152	17157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013412	ATG	2	6	17244	17249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013412	ATA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013412	A	6	6	17360	17365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013412	ATTT	3	12	17374	17385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013412	T	6	6	17383	17388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013412	GTTT	2	8	17637	17644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013412	TCT	2	6	17679	17684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013412	GGT	2	6	18557	18562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013412	T	6	6	18789	18794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013412	A	7	7	18812	18818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013412	CTGT	2	8	18860	18867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013412	TCT	2	6	18876	18881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013412	TCC	2	6	18883	18888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013412	GAC	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013412	ATG	2	6	18911	18916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013412	G	6	6	18916	18921	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013412	GGC	2	6	18924	18929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013412	ATG	2	6	18941	18946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013412	GAG	2	6	18947	18952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013412	TCAA	2	8	18969	18976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013412	CTG	2	6	19018	19023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013412	TGT	2	6	19030	19035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013412	AGA	2	6	19084	19089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013412	GC	3	6	19181	19186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013412	TG	3	6	19223	19228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013412	GGAAGT	2	12	19234	19245	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013412	CTT	2	6	19279	19284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013412	TAG	2	6	19321	19326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013412	CA	3	6	19353	19358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013412	GAC	2	6	19382	19387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013412	TCGGT	2	10	19395	19404	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013412	ATC	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013412	TCC	2	6	19873	19878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013412	TCCC	2	8	19896	19903	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_013412	ATTTT	2	10	19904	19913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013412	T	6	6	19910	19915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013412	A	6	6	19946	19951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013412	CTG	2	6	19985	19990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013412	ACT	2	6	20048	20053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013412	AT	3	6	20124	20129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013412	TCT	2	6	20134	20139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013412	TAT	2	6	20166	20171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013412	ACA	2	6	20176	20181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013412	TAT	2	6	20218	20223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013412	A	7	7	21676	21682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013412	AT	3	6	21698	21703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013412	TA	4	8	21748	21755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013412	ATT	2	6	21761	21766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013412	T	6	6	21813	21818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013412	AGG	2	6	21860	21865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013412	TCAG	2	8	24406	24413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013412	CAA	2	6	24414	24419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013412	AGG	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013412	AG	3	6	25774	25779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013412	CA	3	6	28453	28458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013412	GCGA	2	8	28508	28515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013412	GAA	2	6	28538	28543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013412	T	6	6	28567	28572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013412	A	6	6	28578	28583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013412	CTC	2	6	28640	28645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NC_013412	ACA	2	6	28707	28712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013412	TATAT	2	10	29643	29652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013412	TTTAT	2	10	29659	29668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013412	ACC	2	6	29684	29689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_013412	AT	3	6	29696	29701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013412	A	6	6	29725	29730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013412	GCCTGT	2	12	29982	29993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_013412	CTT	2	6	30071	30076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_013412	CTT	2	6	30128	30133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_013412	TCT	2	6	30152	30157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_013412	CCGG	2	8	30165	30172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_013412	GGC	2	6	30190	30195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_013412	CTA	2	6	31393	31398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_013412	T	7	7	31459	31465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013412	TTTA	2	8	31478	31485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013412	A	6	6	31499	31504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013412	AAC	2	6	31562	31567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013412	AAC	2	6	31626	31631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_013412	CTCC	2	8	31705	31712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
186	NC_013412	AT	3	6	31717	31722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013412	CAA	2	6	31763	31768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_013412	AG	3	6	31771	31776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013412	ACAT	2	8	31790	31797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
190	NC_013412	TAA	2	6	31806	31811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_013412	GAA	2	6	31825	31830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013412	CCT	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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195	NC_013412	AGC	2	6	33013	33018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_013412	CTTC	2	8	33036	33043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_013412	A	7	7	33096	33102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013412	TCCC	2	8	33612	33619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
199	NC_013412	C	6	6	33777	33782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
200	NC_013412	GATA	2	8	33824	33831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_013412	A	7	7	36443	36449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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213	NC_013412	AT	3	6	36602	36607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.